Vnitr Lek 2024, 70(3):174-179 | DOI: 10.36290/vnl.2024.035

Novinky v oblasti bakteriologického vyšetření krve

Miroslava Htoutou Sedláková, Kateřina Bogdanová, Milan Kolář
Ústav mikrobiologie, Fakultní nemocnice Olomouc a Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci

Identifikace etiologického agens v krvi je jedno z nejdůležitějších, ale zároveň nejdelších vyšetření v diagnostice bakteriálních infekcí. Klasický postup hemokultivace za použití automatizovaných přístrojů, identifikace z 24hodinové bakteriální kultury a stanovení kvantitativní citlivosti k antibiotikům trvá zhruba 3-5 dní. V posledních letech byly implementovány do praxe nové metody umožňující identifikaci bakteriálního původce a stanovení citlivosti/rezistence k antibiotikům, včetně detekce genů rezistence pomocí amplifikačních technik, přímo z pozitivních hemokultivačních lahviček. Tyto metody umožňují výrazně zkrátit čas od odběru krve do hlášení výsledku a současně aplikaci cílené antibiotické terapie. Předložený přehledový článek má za cíl seznámit klinické lékaře s novinkami v oblasti bakteriologického vyšetření krve používanými v rutinní mikrobiologické praxi.

Klíčová slova: hemokultury, MALDI-TOF MS, přímá identifikace.

Recent developments in blood bacteriological testing

Identifying the etiological agent in blood is one of the most crucial yet time-consuming investigations in diagnosing bacterial infections. The conventional approach of blood culture utilizing automated systems, followed by identification from a 24-hour bacterial culture and determination of quantitative antibiotic susceptibility, typically takes about 3-5 days. However, in recent years, new methods have been implemented in practice, enabling the identification of bacterial pathogens and the determination of sensitivity/resistance to antibiotics, including the detection of resistance genes through amplification techniques directly from positive blood culture bottles. These methods significantly reduce the turnaround time from blood collection to result reporting, while also facilitating the application of targeted antibiotic therapy. The presented review article aims to acquaint clinical physicians with the latest advancements in the field of blood bacteriological testing.

Keywords: blood cultures, MALDI-TOF MS, direct identification.

Přijato: 26. duben 2024; Zveřejněno: 6. květen 2024  Zobrazit citaci

ACS AIP APA ASA Harvard Chicago Chicago Notes IEEE ISO690 MLA NLM Turabian Vancouver
Htoutou Sedláková M, Bogdanová K, Kolář M. Novinky v oblasti bakteriologického vyšetření krve. Vnitr Lek. 2024;70(3):174-179. doi: 10.36290/vnl.2024.035.
Sdílet...
Stáhnout citaci
  • BibTeX (.bib)
  • Bookends (.ris)
  • EasyBib (.ris)
  • EndNote (.enw)
  • EndNote 8 (.xml)
  • ISI WoS (.isi)
  • Medlars (.medlars)
  • Mendeley (.ris)
  • MODS (.xml)
  • Papers (.ris)
  • RefWorks (.txt)
  • RefManager (.ris)
  • RIS (.ris)
  • MS Word (.xml)
  • Zotero (.ris)
    • Zobrazit celý článek

    Reference

    1. Opota O, Jaton K, Greub G. Microbial diagnosis of bloodstream infection: towards molecular diagnosis directly from blood. Clin Microbiol Infect. 2015;21:323-331. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    2. Bourbeau PP, Foltzer M. Routine incubation of BacT/ALERT FA and FN blood culture bottles for more than 3 days may not be necessary. J Clin Microbiol 2005;43(5):2506-9. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    3. Wilson ML, Weinstein MP, Reinier LG, et al. Controlled comparison of the BacT/Alert and BACTEC 660/730 nonradiometric blood culture systems. J Clin Microbiol. 1992;30:323-9. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    4. Baron EJ, Scott JD, Tompkins LS. Prolonged incubation and extensive subculturing do not increase recovery of clinically significant microorganisms from standard automated blood cultures. Clin Infect Dis. 2005;41:1677-1680. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    5. Petti CA, Bhally HS, Weinstein MP, et al. Utility of extended blood culture incubation for isolation of Haemophilus, Actinobacillus, Cardiobacterium, Eikenella, and Kingella organisms: a retrospective multicenter evaluation. J Clin Microbiol. 2006;44:257-259. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    6. Kolar M, Htoutou Sedlakova M, Urbanek K, et al. Implementation of Antibiotic Stewardship in a University Hospital Setting. Antibiotics. 2021;10(1):93. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    7. Riedel S, Bourbeau P, Swartz B, et al. Timing of specimen collection for blood cultures from febrile patients with bacteremia. J Clin Microbiol. 2008;46(4):1381-5. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    8. Lamy B, Dargère S, Arendrup MC, et al. How to Optimize the Use of Blood Cultures for the Diagnosis of Bloodstream Infections? A State-of-the-Art. Front Microbiol. 2016;12(7):697. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    9. Lee A, Mirrett S, Reller LB, Weinstein MP. Detection of Bloodstream Infections in Adults: How Many Blood Cultures Are Needed? J Clin Microbiol. 2007;45:3546-3548. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    10. Li J, Plorde JJ, Carlson LG. Effects of volume and periodicity on blood cultures. J Clin Microbiol. 1994;32:2829-2831. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    11. Scheer C, Idelevich EA, Annane D, et al. Reported time to blood culture results in hospitals with 24/7 microbiological service compared to hospitals with limited microbiological service: results from an international survey in 870 hospitals. ECCMID 2023.
    12. Drevinek P, Hurych J, Antuskova M, et al. Direct detection of ESKAPEc pathogens from whole blood using the T2Bacteria Panel allows early antimicrobial stewardship intervention in patients with sepsis. Microbiologyopen. 2021;10(3):e1210. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    13. Salar-Vidal L, Fernández-Roblas F, Gadea-Gironés I, et al. T2 magnetic resonance for selected adult patients: experience in a tertiary hospital with sepsis code. ECCMID 2023.
    14. Cheng MP, Stenstrom R, Paquette K, et al. Blood culture results before and after antimicrobial administration in patients with severe manifestations of sepsis: A diagnostic study. Ann of Intern Med. 2019;171(8):547- 554. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    15. Singhal N, Kumar M, Kanaujia PK, et al. MALDI-TOF mass spectrometry: an emerging technology for microbial identification and diagnosis. Front Microbiol. 2015;6:791. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    16. Torres-Sangiao E, Leal Rodriguez C, García-Riestra C. Application and Perspectives of MALDI-TOF Mass Spectrometry in Clinical Microbiology Laboratories. Microorganisms. 2021;9(7):1539. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    17. Morgenthaler NG, Kostrzewa M. Rapid identification of pathogens in positive blood culture of patients with sepsis: review and meta-analysis of the performance of the sepsityper kit. Int J Microbiol. 2015;2015:827416. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    18. Bazzi AM, Rabaan AA, El Edaily Z, et al. Comparison among four proposed direct blood culture microbial identification methods using MALDI-TOF MS. J Infect Public Health. 2017;10(3):308-15. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    19. Azrad M, Keness Y, Nitzan O, et al. Cheap and rapid in-house method for direct identification of positive blood cultures by MALDI-TOF MS technology. BMC Infect Dis. 2019;19(1):72. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    20. La Scola B, Raoult D. Direct Identification of Bacteria in Positive Blood Culture Bottles by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionisation Time-of-Flight Mass Spectrometry. PLoS One. 2009;4(11):e8041. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    21. Ferreira L, Sánchez-Juanes F, Muñoz-Bellido J et al. Rapid method for direct identification of bacteria in urine and blood culture samples by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry: intact cell vs. extraction method. Clin Microbiol Inf. 2011;17(7):1007-1012. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    22. Juiz P, Almela M, Melción C, et al. A comparative study of two different methods of sample preparation for positive blood cultures for the rapid identification of bacteria using MALDI-TOF MS. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2011;31(7):1353-1358. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    23. Yonetani S, Ohnishi H, Ohkusu K, et al. Direct identification of microorganisms from positive blood cultures by MALDITOF MS using an in-house saponin method. Int J Infect Di.s 2016;52:37-42. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    24. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Methodology - EUCAST rapid antimicrobial susceptibility testing (RAST) directly from positive blood culture bottles. [cit. 2023-01-04] : Available from www: https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/RAST/2023/2023_June/EUCAST_RAST_Breakpoint_Table_v_6.1_final_PDF.pdf
    25. Kreidl P, Kirchner T, Fille M, et al. Antibiotic resistance of blood cultures in regional and tertiary hospital settings of Tyrol, Austria (2006-2015): Impacts & trends. PLoS ONE. 2019;14(10):e0223467. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    26. Karlowsky JA, Jones ME, Draghi DC, et al. Prevalence and antimicrobial susceptibilities of bacteria isolated from blood cultures of hospitalized patients in the United States in 2002. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2004;10:3-7. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    27. Wilson J, Elgohari S, Livermore DM, et al. Trends among pathogens reported as causing bacteraemia in England, 2004-2008. Clin Microbiol Infect. 2011;17:451-458. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    28. Htoutou Sedláková M, Fišerová K, Kolář M. Původci bakteriémií ve Fakultní nemocnici Olomouc. Klin mikrobiol inf lék. 2020;26(1):4-11.
    29. Banerjee R, Humphries R. Rapid Antimicrobial Susceptibility Testing Methods for Blood Cultures and Their Clinical Impact. Front Med. (Lausanne) 2021;10(8):635831. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    30. Fiserova K, Htoutou Sedlakova M, Kolar M. The impact of rapid blood cultures identification by MALDI-TOF MS technology. ECCMID 2023, the accepted abstract (Poster number P1564).

    Zpět na obsah


    Vnitřní lékařství

    Vážená paní, pane,
    upozorňujeme Vás, že webové stránky, na které hodláte vstoupit, nejsou určeny široké veřejnosti, neboť obsahují odborné informace o léčivých přípravcích, včetně reklamních sdělení, vztahující se k léčivým přípravkům. Tyto informace a sdělení jsou určena výhradně odborníkům dle §2a zákona č.40/1995 Sb., tedy osobám oprávněným léčivé přípravky předepisovat nebo vydávat (dále jen odborník).
    Vezměte v potaz, že nejste-li odborník, vystavujete se riziku ohrožení svého zdraví, popřípadě i zdraví dalších osob, pokud byste získané informace nesprávně pochopil(a) či interpretoval(a), a to zejména reklamní sdělení, která mohou být součástí těchto stránek, či je využil(a) pro stanovení vlastní diagnózy nebo léčebného postupu, ať už ve vztahu k sobě osobně nebo ve vztahu k dalším osobám.

    Prohlašuji:

    1. že jsem se s výše uvedeným poučením seznámil(a),
    2. že jsem odborníkem ve smyslu zákona č.40/1995 Sb. o regulaci reklamy v platném znění a jsem si vědom(a) rizik, kterým by se jiná osoba než odborník vstupem na tyto stránky vystavovala.

    Ne
    Ano

    Pokud vaše prohlášení není pravdivé, upozorňujeme Vás,
    že se vystavujete riziku ohrožení svého zdraví, popřípadě i zdraví dalších osob.